Pada pelaksanaan kegiatan USDRP terdapat beberapa Institusi yang terkait, seperti Bank Dunia sebagai Institusi yang memberikan pinjaman (Lender). Cipta Karya-Departemen Pekerjaan Umum merupakan institusi yang berperan sebagai Pelaksana Proyek (Executing Agency). Sedangkan Departeman Pekerjaan Umum, Bappenas, Departemen Keuangan dan Departemen Dalam Negeri tergabung dalam Tim Pengarah Antar Departemen (Inter-Ministrial Steering Commite).